核酸定序管理辦法
 

送件需知 收費方式 服務項目 其他

送件需知
  1. 核酸定序核心實驗室位於本院竹南院區研二大樓五樓R2-5214室 。

  2. 收件截止時間:周一至周五上午九點。如遇變更以網頁公告為主。

  3. 收件地點:
    竹南院區-親自放置本院竹南院區研二大樓五樓R2-5211走道小冰箱內檢體專用盒。
    其他院區-寄至本院竹南院區研二大樓五樓R2-5214室。
    地址:苗栗縣350竹南鎮科研路35號 國家衛生研究院核心儀器設施中心R2-5214室。

  4. 服務單:[線上申請 ]
  • 表單請由研究室主持人簽名或蓋職章,該簽名或蓋職章不得影印使用。
  • 檢體命名因為系統轉檔,相容性只能10個字元;檢體命名時不可以重複。
  • 檢體命名可使用字元如下:
    數字:1 2 3 4 5 6 7 8 9 0
    英文字母:A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T U V W X Y Z
    a b c d e f g h I j k l m n o p q r s t u v w x y z
    符號:+ - # ( )
  1. 檢體:
  • 檢體請裝於0.5 ml Eppendorf離心管,內含DNA template及一種 primer (10uM/1 μl),再以無菌蒸餾水將總體積補至8μl 。如需要本單位添加primer,請將總體積補至6.5μl。

  • DNA template的量:
    PCR product:電泳凝膠圖使用PCR products 2μl 與100bp DNA ladder Marker 2μl 中的500bp片段比較亮度,需強過Marker。
    PCR 200-500bp 約取3~4 μl
    PCR 500-1000bp 約取5~7 μl
    Plasmid :400~500ng
    OD260/OD280 值位於1.75-1.89
    OD260/OD230 值大於2.2
  • Primer免費添加其種類及序列如下:
    T7: 5’   TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG 3’
    SP6: 5’   GAT TTA GGT GAC ACT ATA G 3’
    M13F(-21):5’   TGT AAA ACG ACG GCC AGT 3’
    M13Rev: 5’ GGA AAC AGC TAT GAC CAT G 3’
  • 檢體標示:
    a.單管部分:離心管蓋子頂部標明送件者之英文縮寫(與服務單上相同)、編號,側邊管壁註明檢體名稱(十個以內英文字母或阿拉伯數字)並確定與申請單上相同。
    b.96孔盤部分:請用96孔0.2ml PCR plate,並用鋁箔膠帶緊密封閉,勿使用塑膠膜,以避免檢體揮發。96孔盤前緣請標示plate name。
  1. 已做好反應送96孔盤者請使用ABI3730上機專用反應盤。
    選擇收費標準第五項,做定序反應請做好酒精沉澱。
    已做好反應需在螢光反應完成48小時內,以冷凍方式交由本單位上機。

  2. PCR products進行核酸定序工作前請自行去除殘留的 primer及dNTP 。再加入新primer,
    核酸定序反應只允許一種primer及單一種DNA片段。

  3. 片段分析STR與SNaPshot其ladder由本單位免費提供如下:
    STR提供GS-500Liz,GS-400Liz
    SNaPshot提供GS-120Liz
    如果非使用這些ladder請自行添加。

  4. SNaPshot 於primer設計長度請遵守20,36,44,52,60,68….長度。

  5. 核酸定序結果以電腦檔案輸出,不含文字檔;片段分析除原始檔外,含其分析文字檔。

  6. 本辦法可加速檢體處理時效,若服務單填寫或檢體標示不合或不清楚者,本單位有權退回申請案。

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收費方式
  1. 每月統計累積定序費用,於下個月10日前交由會計室扣款。

  2. 每年11月至隔年4月所累積定序費用於隔年5月扣款。

  3. 計劃主持人因故離職前,需繳清累積定序費用。

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服務項目
  1. DNA定序。

  2. DNA定序問題解答。

  3. 代客DNA sequencing及Genotyping片段分析上機。

  4. 免費Primer 添加服務:限加 T7、SP6、M13Rev 及 M13F(-21)。

  5. 軟體服務:片段分析以GeneMapper v4.0菌種鑑定以MicroSeqID v2.1開放登記使用。

  6. 分析結果保存二個月。

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其他
  1. 服務單保存二年後自行銷毀。

  2. 每三個月公佈各單位服務數量統計百分比。

  3. 辦法如有未盡事宜,修改後再行公布。

  4. 有疑問請連絡核酸定序核心實驗室蘇特立先生,分機 33705。

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公告日:2011/04/01





◆地址:苗栗縣竹南鎮350科研路35號 ◆Tel :037-246166 ext.33705 ◆Fax:037-586674  ◆Mail:seqcore@nhri.org.tw
Copyright © 2010 核心儀器設施中心 核酸定序核心實驗室 實驗室管理與操作者:蘇特立(分機:33705)。